Bitki sağlığı kontrolüne ek olarak, sıkı bir veteriner kontrolü de bulunmaktadır. Sıhhi ve epidemiyolojik kontrolün bir parçasıdır ve sınır geçiş noktalarında gerçekleştirilmektedir. Veteriner kontrolü, sınır kontrol veterinerlik noktalarında yapılan ve yasal düzenlemelerle belirtilen diğer yerlerde yapılan sağlık-epidemiyolojik kontrolün bir bölümünü ifade eder.

Zorunlu veteriner kontrolü, hayvancılık, kümes hayvanları, balık ürünleri, kümes hayvanları ürünleri, balık ve hayvan ürünlerinden yapılan çeşitli ürünlere tabidir. Bu aynı zamanda hayvan dünyasının canlı temsilcilerini, hayvan bileşenlerine dayalı müstahzarların yanı sıra derileri, yünleri, kürkleri, boynuzları, kemikleri, yemleri ve koleksiyonları içerir.